分析：地球上所有的生物，它們所擁有的全部基因以及各種生態(tài)系統(tǒng)共同構(gòu)成了生物多樣性．生物多樣性包括物種多樣性、遺傳多樣性和生態(tài)系統(tǒng)多樣性三個層次．物種多樣性的實質(zhì)是遺傳多樣性，生態(tài)系統(tǒng)多樣性是生物多樣性的外在形式．
解答：解：生物種類的多樣性是指一定區(qū)域內(nèi)生物鐘類（包括動物、植物、微生物）的豐富性，如人類已鑒定出的物種，大約有170多萬個，我國已知鳥類就有1244種之多，被子植物有3000種，即物種水平的生物多樣性及其變化．基因的多樣性是指物種的種內(nèi)個體或種群間的基因變化，不同物種（兔和小麥）之間基因組成差別很大，生物的性狀是由基因決定的，生物的性狀千差萬別，表明組成生物的基因也成千上萬，同種生物如兔之間（有白的、黑的、灰的等）基因也有差別，每個物種都是一個獨特的基因庫．基因的多樣性決定了生物種類的多樣性；生物種類的多樣性組成了不同的生態(tài)系統(tǒng)；生態(tài)系統(tǒng)的多樣性是指生物群落及其生態(tài)過程的多樣性，以及生態(tài)系統(tǒng)的環(huán)境差異、生態(tài)過程變化的多樣性是指生物所生存的生態(tài)環(huán)境類型的多樣性等．
故選D
點評：生物多樣性通常有三個主要的內(nèi)涵，即生物種類的多樣性、基因（遺傳）的多樣性和生態(tài)系統(tǒng)的多樣性．
